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南通港口集團有限公司是江蘇省南通市最大的公用港口企業，前身為南通港務局，2002年政企分開后成立，2005年底成為中外合資企業，2017年變更為國有法人獨資的市屬一類企業，注冊資本人民幣9.66億元。南通港口集團現有3家下屬分公司、9家全資及控股子公司和4家參股公司。南通港集團有限公司是2017年1月南通市委市政府為整合全市港口資源、推進市域港口一體化運營管理設立的市屬一類國有企業，注冊資本人民幣66億元。南通港集團現有1家全資子公司、1家參股公司。南通港集團、南通港口集團目前實行“兩塊牌子、一套班子”運作模式。

集團現有如皋港區橫港沙作業區、通海港區、通州灣港區“三大基地”，已建成碼頭岸線總長度2762.5米，泊位數10個（其中萬噸級以上泊位9個），堆場面積總計約110萬平方米，總設計吞吐能力1484.9萬噸、326萬標箱。集團主要從事港口碼頭相關基礎設施的投資建設與運營管理，港區鐵路建設運營，臨港型物流園區投資建設，船貨代理、綜合物流業務及理貨，港口相關產業項目的投資、運營和管理，船舶拖帶、航修及水上服務等業務。